KOGゲノム解析システムは以下のセキュリティーガイドラインを遵守しており、NBDC機関外サーバとして利用ができる、3例目の計算機です。
NBDCヒトデータ取扱いセキュリティガイドラインおよびNBDCヒトデータグループ共有データ取扱いセキュリティガイドライン チェックリスト
主に計算機、高速ストレージ、アーカイブストレージの3つで構成されています。仕様は以下のとおりです。
1. 計算ノード:合計約2000コアノード数 | OS | CPU | CPUコア数 (ノードあたり) |
メモリ容量 (ノードあたり) |
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計算ノード | 25 | CentOS 8 | AMD EPYC 7742(2.25GHz) x1 | 64 | 512GB |
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計算ノード(大容量メモリ) | 2 | CentOS 8 | AMD EPYC 7742(2.25GHz) x2 | 128 | 4096GB |
ノード数合計ディスク容量 | |
Lustre | 2.3PB |
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Tape Drive数 | 容量 | |
Quantum Scalar i6 LTO8 Tape Library | 2 | 6PB |
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名称 | |
計算用ネットワーク | 100Gbps EDR InfiniBand |
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管理用ネットワーク | 10Gbps Ethernet |
Queue名 | スロット数 (Queue全体) |
スロット数 (ノードあたり) |
メモリ (Queue全体) |
メモリ (ノードあたり) |
実行時間の上限 |
lmem.q(大容量メモリジョブ) | 256 slot | 128 slot | 8 TB | 4 TB | 31 日 |
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node.q(通常ジョブ) | 1200 slot | 64 slot | 10.2 TB | 512 GB | 31 日 |
qlogin.q(対話ジョブ) | 128 slot | 64 slot | 1 TB | 512 GB | 無制限 (無操作6時間で自動ログアウト) |